Puzzle 2048 itabadilika sana katika 2048 Run 3D. Badala ya tiles, utadhibiti mpira na maadili ya nambari yaliyochorwa juu yake. Atabadilisha rangi na thamani katika mchakato wa harakati, na kwa hili anahitaji kugongana na mipira ya rangi sawa na nambari. Kazi ni kufikia mstari wa kumalizia na mpira na nambari ya juu upande wake.